E-zavod ima bogate izkušnje na področju tehnične pomoči, povezane z EU sredstvi, ki jo nudi organom upravljanja in ministrstvom.
Najpomembnejši referenčni projekti tehnične pomoči ministrstvom:
- povečanje konkurenčnosti invalidskih podjetij v Srbiji, Ministrstvo za delo in socialne politike, Srbija, 2007/08,
- tehnična pomoč MOP pri pripravi in izvedbi projekta Trajnostna energija in ekonomija vodika, Ministrstvo za okolje in prostor, 2007,
- tehnična pomoč in podpora upravičencem Evropskega socialnega sklada, SVLR, 2009,
- tehnična pomoč pri zaključevanju finančne perspektive 2004-2006, SVLR, 2009,
- izdelava študije za utemeljitev stopnje posrednih stroškov ESS, 2009,
- izdelava zaključnega poročila za koriščenje EU sredstev iz naslova ISPA, Ministrstvo za promet, 2010.
Referenčni projekti finančnih in vsebinskih kontrol EU projektov:
- pregled zahtevkov za izplačila, preverjanje dokazil, priprava zahtevkov za povračila, Ministrstvo za visoko šolstvo znanost in tehnologijo, 2009/10,
- izvajanje prvostopenjske kontrole za čezmejni program Slovenija-Italija, 2012,
- izvajanje prvostopenjske kontrole za čezmejni program Slovenija-Hrvaška, 2012/13.